يقع دير الانبا توماس قرب نجع عرب بنى واصل وعلى مسافة 16كم شمال اخميم ويبعد 5كم شمال قرية الصوامعة على الطريق بجوار الجبل الشرقى
وتتكون المبانى المتبقة من الدير من كنيسة صغيرة وحجرتين ماحقتين بها تتكون الكنيسة من هيكل من هيكل نصف دائى به الحنيات على محيطه الدائرى ويتوسطه مذبح اعلاه فيه خشبية بها صور القديس وسط الملائكة والقديسين
وعلى جانبى الهيكل والحجرات الجانبية عن صحن الكنيسة خورس صغير ينتهى بحنيات كبيرة ويفتح على باقى صحن الكنيسة للقرن 16و17م وان كان موقع الدير يرجع الى ما قبل ذلك
والقديس انبا شنودة هو الذى قام بتكفين جسد الانبا توماس وكان يعاونه بعض تلاميذه من الرهبان فى الجبل الغربى وكان انبا توماس اعلن للانبا شنودة عن علامات يوم نياحته وجسد الانبا توماس مدفون فى حجرة عن يمين المذبح الرئيسى بالدير واعتراف به المجمع المقدس ويشهد علامات روحية وبخور اثناء التماجيد المقدسة
كما ان الدير موجود فى قرية عرب بنى واصل وهى قرية لايوجد بها بيت مسيحى واحد الا ان الدير يشهد بالعمران الحديث وعمل النعمة الملحوظ
