تعد كنيسة السيدة العذراء بدير مارمينا بمريوط، التابع للكنيسة القبطية الأرثوذكسية، هى ثانى كنيسة بنيت فى الدير بعد كنيسة الأنبا صموئيل المعترف الصغيرة جدا.
حيث افتتحت الكنيسة للصلاة عام 1961 ميلادية، ويجد بها ثلاثة مذابح ومنارة واحدة منقوش على الأوجه الأربعة لها عبارة "القديس مينا "باللغة اليونانية وهى نفس العبارة التى كانت تنقش على القوراير الفخارية لمياه نبع القديس مارمينا التى يحملها الحجاج المسيحيون إلى كل أرجاء العالم.
يذكر أن مصمم نقش المنارة هو الأثرى الفنان "بديع عبد الملك" العضو المؤسس بجمعية مارمينا للدراسات القبطية بالإسكندرية التى عاونت البابا كيرلس السادس فى إعادة اعمار الدير.
والثابت تاريخيًا أن البابا كيرلس السادس أحد بابوات كرسى مارمرقس الرسول، وضع حجر أساس دير الشهيد مارمينا العجائبى بمريوط، وأعاد إحياء المنطقة فى 27 نوفمبر 1959، بمناسبة الاحتفالات الخاصة بذكرى استشهاد القديس
مارمينا، كما يعد الدير القديم أحد المناطق الأثرية المهمة فى العالم، بعدما تم تسجيل المنطقة الأثرية فى سجل أهم المناطق التراثية بمنظمة اليونيسكو، ويعود تاريخ الدير القديم إلى وقت وصول رفات الشهيد مارمينا
واستقراره فى مزاره القديم بالآثار عام 315، وبنيت أول كنيسة للشهيد بمريوط بين عامى 320 325 فى عهد الملك قسطنطين الكبير، وتزايد عدد الزوار وطالبى المعجزات والتبارك بالقديس، جدد البابا أثناسيوس الرسولى الكنيسة الأولى ووسعها كثيرًا.
